Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TMOD4Q9NZQ9 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms