Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms