Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ELOC-205ENST00000520210 1451 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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