Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms