Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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ITGB3BPQ13352 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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ITGB3BPQ13352 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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ITGB3BPQ13352 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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ITGB3BPQ13352 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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