Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SP140Q13342 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SP140Q13342 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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