Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
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