Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CTNNB1P35222 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms