Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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RFXAPO00287 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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