Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ERVV-1B6SEH8 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ERVV-1B6SEH8 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms