Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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NRF1Q16656 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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NRF1Q16656 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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NRF1Q16656 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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NRF1Q16656 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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NRF1Q16656 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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NRF1Q16656 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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NRF1Q16656 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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NRF1Q16656 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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NRF1Q16656 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NRF1Q16656 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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