Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USF2Q15853 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USF2Q15853 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USF2Q15853 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USF2Q15853 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USF2Q15853 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USF2Q15853 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USF2Q15853 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USF2Q15853 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USF2Q15853 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USF2Q15853 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USF2Q15853 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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