Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SS18Q15532 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SS18Q15532 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SS18Q15532 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SS18Q15532 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SS18Q15532 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SS18Q15532 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SS18Q15532 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SS18Q15532 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SS18Q15532 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SS18Q15532 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms