Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms