Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms