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| CHD4 | Q14839 | LINC02035-201 | ENST00000610128 | 5476 nt | BASIC | 6.79 | □□□□□ -1.32 | | |
| CHD4 | Q14839 | RFC3-202 | ENST00000434425 | 1461 nt | TSL 5 BASIC | 6.79 | □□□□□ -1.32 | | |
| CHD4 | Q14839 | KIAA0391-209 | ENST00000604948 | 1706 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 6.79 | □□□□□ -1.32 | | |
| CHD4 | Q14839 | HNMT-203 | ENST00000329366 | 835 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.79 | □□□□□ -1.32 | | |
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| CHD4 | Q14839 | Z95114.1-201 | ENST00000624264 | 14574 nt | BASIC | 6.78 | □□□□□ -1.32 | | |
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| CHD4 | Q14839 | NEGR1-202 | ENST00000357731 | 12811 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.32 | | |
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| CHD4 | Q14839 | LINC00293-204 | ENST00000521715 | 1498 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | RFX4-203 | ENST00000392842 | 3955 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | LINC01793-201 | ENST00000409590 | 2036 nt | TSL 2 BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
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| CHD4 | Q14839 | PAICS-201 | ENST00000264221 | 3339 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | IPCEF1-201 | ENST00000265198 | 6689 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | SIAH1-202 | ENST00000380006 | 3352 nt | APPRIS P3 BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | SLC5A12-201 | ENST00000280467 | 2269 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC073342.2-201 | ENST00000595842 | 1800 nt | BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
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| CHD4 | Q14839 | IGLV7-43-201 | ENST00000390298 | 385 nt | APPRIS P1 BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
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| CHD4 | Q14839 | AL158154.1-201 | ENST00000427387 | 465 nt | TSL 3 BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | MEMO1P4-201 | ENST00000453590 | 386 nt | BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
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| CHD4 | Q14839 | LINC02313-201 | ENST00000553330 | 550 nt | TSL 2 BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | NPM1P42-201 | ENST00000560329 | 862 nt | BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC099518.4-204 | ENST00000567047 | 380 nt | TSL 2 BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC040173.1-201 | ENST00000572479 | 580 nt | TSL 4 BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
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| CHD4 | Q14839 | CREM-202 | ENST00000342105 | 1541 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | RUFY3-202 | ENST00000381006 | 3098 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | ZNF969P-201 | ENST00000510345 | 2341 nt | BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | ZNF345-215 | ENST00000614069 | 3103 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | ZBTB21-205 | ENST00000398511 | 5608 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | TEX14-203 | ENST00000389934 | 4927 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | CLIP1-AS1-201 | ENST00000535976 | 1745 nt | TSL 3 BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | CPEB2-AS1-202 | ENST00000501916 | 1806 nt | TSL 2 BASIC | 6.77 | □□□□□ -1.33 | | |
| CHD4 | Q14839 | RWDD2A-201 | ENST00000369724 | 3744 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.76 | □□□□□ -1.33 | | |