Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms