Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCOF1Q13428 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
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