Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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SP140Q13342 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SP140Q13342 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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