Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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