Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GPS1Q13098 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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