Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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