Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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FOXF1Q12946 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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FOXF1Q12946 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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FOXF1Q12946 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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FOXF1Q12946 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXF1Q12946 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
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