Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TWF1Q12792 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms