Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms