Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMPOP42166 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TMPOP42166 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TMPOP42166 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TMPOP42166 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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