Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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HOXD13P35453 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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HOXD13P35453 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD13P35453 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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