Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 494.3 ms