Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCSER1Q9C0I3 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms