Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms