Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms