Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 STX2-203ENST00000392373 2151 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TAS2R60-201ENST00000332690 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 S100A13-202ENST00000392622 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RPL34-201ENST00000394665 529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL023773.2-201ENST00000412173 1005 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC009501.2-201ENST00000428700 312 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL450311.1-201ENST00000434931 576 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL356481.1-201ENST00000434999 578 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL645568.1-202ENST00000437190 1016 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 CHRM3-AS1-201ENST00000444721 486 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 YAE1D1-203ENST00000448268 425 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC100771.1-201ENST00000496450 279 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 FAM197Y9-203ENST00000505707 345 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AP002026.1-205ENST00000509295 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC004066.2-201ENST00000514879 572 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 CA1-219ENST00000523022 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL929601.1-202ENST00000551067 418 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC005829.1-202ENST00000562555 298 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP23P1-202ENST00000567025 423 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC119868.1-201ENST00000579307 336 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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ANKRD39Q53RE8 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 DPPA5P1-201ENST00000600430 340 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RN7SL620P-201ENST00000610816 303 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 GNAS-AS1_2.1-201ENST00000613404 114 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC244196.3-201ENST00000614171 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 FAM197Y4-201ENST00000616275 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.197-201ENST00000618956 303 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 FAM197Y5-203ENST00000619815 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LAMTOR5-AS1-236ENST00000626261 464 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LRMP-205ENST00000548766 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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