Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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