Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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