Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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SIX1Q15475 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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SIX1Q15475 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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SIX1Q15475 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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SIX1Q15475 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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SIX1Q15475 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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SIX1Q15475 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SIX1Q15475 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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