Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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