Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms