Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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IFT88Q13099 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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