Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LMAN2Q12907 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms