Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms