Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD13P35453 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms