Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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HOXD10P28358 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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