Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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ZBED1O96006 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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ZBED1O96006 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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ZBED1O96006 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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ZBED1O96006 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ZBED1O96006 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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