Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CEP290O15078 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CEP290O15078 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CEP290O15078 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CEP290O15078 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CEP290O15078 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CEP290O15078 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP290O15078 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP290O15078 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP290O15078 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP290O15078 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP290O15078 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP290O15078 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP290O15078 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP290O15078 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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CEP290O15078 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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CEP290O15078 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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CEP290O15078 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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CEP290O15078 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CEP290O15078 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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