Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms