Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms