Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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SEMA4DQ92854 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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SEMA4DQ92854 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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SEMA4DQ92854 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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SEMA4DQ92854 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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SEMA4DQ92854 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SEMA4DQ92854 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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