Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC073091.1-201ENST00000398059 864 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 HNRNPCP2-201ENST00000399515 881 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SNRPCP9-201ENST00000417250 207 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 C3orf18-202ENST00000422619 551 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SLC2A1-AS1-202ENST00000431759 1124 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01526-201ENST00000441949 520 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ELOBP1-201ENST00000447693 357 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 IGKV1D-39-201ENST00000448155 376 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC023141.2-201ENST00000449138 550 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SNX18P4-201ENST00000456554 838 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC098487.1-204ENST00000506972 610 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC010307.4-202ENST00000507403 389 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 NTAN1P2-201ENST00000515730 940 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RNF185-AS1-201ENST00000526089 353 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC113143.1-201ENST00000534670 301 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TMEM132D-AS1-206ENST00000541320 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC073913.2-201ENST00000541512 145 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC073651.2-201ENST00000544148 660 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 VDAC2P2-201ENST00000544463 901 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PCAT29-203ENST00000559212 647 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC021818.1-201ENST00000561316 547 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC009121.2-201ENST00000572913 714 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 USP2-AS1-204ENST00000577297 689 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RN7SL712P-201ENST00000579354 308 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC009303.2-209ENST00000588733 853 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC104532.2-201ENST00000591109 589 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL080285.2-201ENST00000612765 458 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ACACA-232ENST00000614438 569 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TSPAN16-206ENST00000621731 642 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.1 ms