Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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