Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MSANTD3-206ENST00000613183 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC245505.2-201ENST00000553572 3055 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms